Borneo FC Samarinda resmi ditunjuk Konfederasi Sepak Bola Asia (AFC) sebagai salah satu tuan rumah fase grup AFC Challenge League musim 2026/2027. Keputusan penting ini diumumkan AFC pada Jumat, 14 Agustus 2026, menandai pengalaman perdana bagi Pesut Etam untuk berlaga di ajang resmi tingkat benua.

Dengan penunjukan ini, Stadion Segiri di Samarinda akan menjadi panggung bagi pertandingan antarklub Asia. Kepercayaan dari AFC ini tidak hanya sebatas status peserta, melainkan juga tanggung jawab untuk menyiapkan penyelenggaraan pertandingan fase grup. Borneo FC akan berbagi tugas sebagai tuan rumah bersama empat klub lainnya, yaitu Al Qadsia dari Kuwait, FC Istiklol (Tajikistan), Paro FC (Bhutan), dan Shan United (Myanmar).

Penunjukan Samarinda sebagai tuan rumah menjadi sinyal kuat bahwa kota tersebut dianggap memiliki fasilitas, kesiapan penyelenggara, dan atmosfer sepak bola yang memadai untuk menggelar pertandingan internasional. Borneo FC sendiri mengamankan tiket ke AFC Challenge League setelah berhasil finis sebagai runner-up Super League 2025/2026. Mereka berada di bawah Persib Bandung yang keluar sebagai juara dan berhak atas tiket AFC Champions League Two melalui jalur playoff.